Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF4Q08170 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms