Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms