Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PSME1Q06323 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSME1Q06323 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms