Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms