Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms