Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB3Q04118 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms