Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC4Q03721 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms