Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A3Q01959 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms