Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms