Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FANCCQ00597 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms