Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBB4BP68371 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms