Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP1P63208 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKP1P63208 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKP1P63208 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKP1P63208 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP1P63208 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms