Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERVK_113P62684 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERVK_113P62684 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms