Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms