Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP3S2P59780 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms