Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP107P57740 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP107P57740 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP107P57740 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP107P57740 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms