Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME5P56597 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME5P56597 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NME5P56597 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME5P56597 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME5P56597 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms