Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF1P55201 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms