Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms