Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA4P51532 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SMARCA4P51532 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms