Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBP2P50120 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBP2P50120 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBP2P50120 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBP2P50120 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBP2P50120 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBP2P50120 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBP2P50120 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBP2P50120 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBP2P50120 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBP2P50120 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBP2P50120 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBP2P50120 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBP2P50120 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBP2P50120 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBP2P50120 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBP2P50120 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBP2P50120 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBP2P50120 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBP2P50120 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBP2P50120 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBP2P50120 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBP2P50120 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBP2P50120 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBP2P50120 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBP2P50120 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms