Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms