Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCT3P49368 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCT3P49368 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCT3P49368 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCT3P49368 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCT3P49368 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCT3P49368 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCT3P49368 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCT3P49368 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCT3P49368 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCT3P49368 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms