Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms