Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGM4P49221 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TGM4P49221 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms