Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASP3P42574 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP3P42574 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms