Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFNP31947 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFNP31947 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFNP31947 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFNP31947 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SFNP31947 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFNP31947 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFNP31947 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms