Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NMBRP28336 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NMBRP28336 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMBRP28336 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMBRP28336 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms