Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms