Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMLP26374 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMLP26374 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMLP26374 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMLP26374 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMLP26374 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMLP26374 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMLP26374 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMLP26374 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMLP26374 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms