Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA3P26006 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms