Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms