Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRB1P17538 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms