Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms