Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP1P11387 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP1P11387 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP1P11387 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP1P11387 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP1P11387 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP1P11387 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP1P11387 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP1P11387 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP1P11387 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOP1P11387 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP1P11387 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP1P11387 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP1P11387 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP1P11387 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP1P11387 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP1P11387 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP1P11387 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOP1P11387 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOP1P11387 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TOP1P11387 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOP1P11387 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOP1P11387 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOP1P11387 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOP1P11387 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms