Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMP10P09238 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMP10P09238 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP10P09238 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP10P09238 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms