Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPBP07199 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPBP07199 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPBP07199 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPBP07199 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms