Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA4P06727 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA4P06727 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA4P06727 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA4P06727 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA4P06727 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA4P06727 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA4P06727 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA4P06727 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA4P06727 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms