Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-DQB1P01920 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLA-DQB1P01920 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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