Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSD2O96028 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSD2O96028 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSD2O96028 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSD2O96028 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSD2O96028 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSD2O96028 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSD2O96028 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSD2O96028 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSD2O96028 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSD2O96028 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSD2O96028 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms