Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAF4O95104 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCAF4O95104 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAF4O95104 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCAF4O95104 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCAF4O95104 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCAF4O95104 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SCAF4O95104 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAF4O95104 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAF4O95104 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAF4O95104 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SCAF4O95104 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCAF4O95104 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCAF4O95104 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCAF4O95104 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms