Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFL1O94874 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFL1O94874 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFL1O94874 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms