Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA10O75578 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms