Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKAP2O75563 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKAP2O75563 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms