Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP9BO43861 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms