Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD6O43541 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD6O43541 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms