Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD8O14715 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms