Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP23O00161 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP23O00161 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms