Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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