Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHMG1C9JSJ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHMG1C9JSJ3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms